Contrairement aux GMT qui constituent des projets émanant directement du CODESRIA et sont toujours multinationaux dans leur composition, les Groupes nationaux de travail sont des initiatives autonomes provenant des membres de la communauté de chercheurs basés dans un quelconque pays africain et souhaitant étudier un phénomène dans un pays donné. Les participants d’un GNT identifient alors le domaine de recherche qui les intéresse et formulent leur problématique de recherche à travers une proposition qui dégage également leurs priorités. Dans ce sens, les GNT sont mis en place et soutenus sur la base d’un besoin national identifié. Les initiateurs de propositions de création de GNT sont toujours invités par le Conseil à tenir compte de son souci constant de transcendance des barrières disciplinaires, de genre et de génération dans la production intellectuelle. L’autonomie du GNT est considérée comme un principal facteur de réussite ; il fait également partie intégrante de la stratégie du CODESRIA consistant à renforcer les capacités nationales de recherche, ainsi que les contacts interdisciplinaires au niveau national. Le Secrétariat du CODESRIA reçoit continuellement des propositions de création de GNT, qui sont évaluées grâce à un processus indépendant impliquant des chercheurs connaissant bien la situation du pays et la problématique à étudier. Chaque GNT est encouragé à tenir un atelier méthodologique avec l’ensemble de ses membres, ainsi qu’un atelier d’évaluation à mi-parcours pour mesurer les progrès réalisés par chacun des membres. La durée moyenne d’un GNT est de 18 mois

NWGs 2005

• Politics of Antiretroviral therapy for people living with HIV/AIDs in Nigeria
• Sustaining agriculture and forest land uses in the Afram Plains of Ghana
• Gender, Culture and women participation and performance in banana trade in Tanzania: a value case analysis
• Libéralisation du commerce et contrôle de l’hygiène alimentarie à Oagadougou
• Espaces, culture matérielle et identities en Sénégambie
• Accompagnment des entrepreneurs: genre et performance des TPE/PE en phase de demarrage dans les villes de Douala et Yaounde

NWGs 2004

• Crise Socio-Politique, Re-Compositions Identitaires et Processus de Construction de l’Idée de Nation en Côte d’Ivoire
• Conflits Armés et Refondation de l’Etat au Congo-Kinshasa
• Popular Forms of Accountability in Nigeria
• Transforming Gender Relations – Exploring Masculinities in the making of the Ghanaian Nation(Aloysius Denkabe)
• Globalization and International Migration from Zimbabwe
• Representations of disease and healing practices: A look at Handa therapeutic practices and pharmacopoeia
• Dimensions of poverty and vulnerability in Cape-Verde: A systemic and interdisciplinary approach
• Bijagos: Structure and functioning of traditional power (Guine-Bissau)
• Analysis of socio-spatial dynamics in Nampula city

NWGs 2003

• Le Maroc actuel : crise du modèle de développement et dynamique de changement politique
• Marketization Versus Equity: The Implications of Privatization of Higher Education on Access and Knowledge Production in  Kenya
• Ghana - One decade of the liberal state
• Rethinking national security in the post colonial African state : envisioning new aesthetic and ethical imperatives for viable internal security and sustainable integration
• Federal presence in Nigeria : the sung and unsung basis of ethnic grievance
• Facteurs de transition de la micro entreprise à l'entreprise capitaliste moderne : un exam du cas de la République Démocratique du Congo
• Civil Society and the search for development alternatives in Cameroon
• Le processus démocratique au Bénin : genèse, dynamique et perspectives
• L'industrie musicale au Sénégal : aspects socioculturels politiques, économiques et juridiques

NWGs 2002

• L'Algérie face à la mondialisation
• Evaluation de la décentralisation des services de santé au Congo. Le cas des circonscriptions de Pointe-Noire et de Ouesso
• Armée et politique au Niger
• Innovative approaches in the establishment, operation and management of a young African university - the experience of the University of the Gambia
• Democratization process in Kenya